為了保證濕儲存的秸稈品質和保持較長的儲存期，必須對儲存操作規范提出嚴格技術要求。收割要盡量減少切口數量，若是聯合收割機，在機上同時粉碎，就要減少堆放時間，并用拋物方法使物料降溫后拋人儲存倉，同時配以碾壓。從收割到粉碎封裝，一般控制在4h內，倉外堆積時間控制在1h之內，盡可能減少采收后秸稈與空氣長時間接觸，以防止秸稈有機質的糖化降解；倉內堆積密度控制在0. 4～0.6t/m3，盡可能排出體系內的殘余空氣，削弱微生物的活動；儲存過程中，要嚴格監視體系內的pH。封裝后秸稈上往往附著有乳酸菌、乙酸菌、腐敗菌等，在適合的溫度、水分條件下，利用采收時秸稈中的可溶性糖類作呼吸碳源，產生乳酸、乙酸等，可使體系的pH迅速降低至4.2以下，抑制微生物的生物活性，保證秸稈儲存的穩定性。
    在整個儲存過程中，必須保證乳酸發酵的主導地位，其原因主要是由于乳酸的酸性要比有機羧酸的酸性強得多，體系酸度值降低得更快一些。如果秸稈附著的乳酸菌較少，可以向秸稈中噴灑乳酸菌，必要時可向秸稈體內增加一些有機酸如甲酸、乙酸、丙酸以及它們兩種或兩種以上酸的復配物等，必要時噴撒無機酸稀釋液，如硫酸、磷酸等，似調整體系內酸度值，使得酸度值迅速下降，抑制霉菌、腐爛菌等生物活性。特別需要說明的是濕儲存體系不得加入酶制劑如纖維素酶等，防止秸稈有機高分子的降解，否則，秸稈中有機質損失更大，熱值損失會更高。
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