作物秸稈收獲的特點是，時間短，量大分散，含水量高，切割后氧化發熱快。這種特征不宜滿足秸稈利用的規模化、產業化連續生產要求，也是技術障礙。本節闡述秸稈濕儲存的基本原理，采取濕儲存技術后，秸稈主要有機成分含量的變化規律以及建設濕儲存裝置的工程技術關鍵。秸稈濕儲存理論基礎
所謂濕儲存，是作物采收果穗后的秸稈，不經過風干脫水立即進行切段或粉碎，裝入儲存裝置并密封封裝的過程。濕儲存的目標是，在規模化儲存器中，避免濕秸稈發熱，只脫水不發酵，盡可能減少秸稈的有機質降解，減少熱值損失。本節所述秸稈能源化利用的儲存技術不同于糖化儲存，要點是盡可能避免儲存過程中發酵反應的發生，儲存期內（1年以上）能量損失最少。
秸稈濕儲存的過程，是一個復雜生物化學變化過程。濕儲存的操作技術，應當盡可能減少秸稈有機質發生糖化：即有機質高分子由于降解，其分子質量變小；同時，也盡可能減少可溶性糖類分解形成C02的量，否則，秸稈由于有機質降解而流失較多，導致熱值損失過大。
秸稈濕儲存過程可以分為三個階段：好氧呼吸階段、兼氧呼吸階段和穩定保存階段。好氧呼吸階段，也就是秸稈濕儲存的開始階段，該階段在秸稈切碎密封儲存后，因秸稈內含有大量的可溶性糖分等物質，與呼吸有關并具有生物活性的酶可進行呼吸作用，它利用體系內殘余空氣，分解秸稈的有機質。同時，附著在秸稈上的好氧性細菌、兼氧性細菌、酵母菌、腐敗菌、乙酸菌等也利用秸稈的可溶性糖類進行繁殖生長，迅速消耗殘余氧氣，產生C02、醇類、乙酸、乳酸等以及相應的熱量，待02耗盡后，濕儲存體系就形成了厭氧環境。厭氧、適宜溫度和微酸性環境為乳酸菌的繁殖創造了合適的條件。在該階段對秸稈產生較強的破壞作用。因此，此階段如果殘余空氣較多，細胞呼吸時間就會延長，產生較多熱量，設備內溫度就會升高，阻礙乳酸菌與其他微生物的競爭，使秸稈有機質的結晶度遭到破壞，甚至降解成為小分子物質，秸稈糖化率就會升高，導致熱值損失增大。因此，為了減弱這些過程的產生，秸稈收獲后應盡量縮短秸稈進入儲存倉的時間，秸稈不易受切割粉碎傷痕太多，以防止秸稈快速氧化發熱。因此封裝時要盡可能短時間內將秸稈進行壓實密封，減少秸稈體系內殘余空氣，降低秸稈有機質糖化的程度、各乳酸菌發揮作用的環境和條件，避免發酵過程發生。
厭氧（兼氧）呼吸階段，就是在缺氧條件下，如果具有適當的溫度、一定的含糖量、一定的含水量，兼氧性細菌和乳酸菌等利用體系中可溶性糖類、水分以及其他營養物質，逐漸活躍起來，迅速繁殖，產生大量的乳酸、乙酸、丁酸等，使體系內的pH降低，當pH降低在4.2以下時，就會抑制其他各種腐敗菌群的活動，乳酸菌的活動也由于酸度值的降低而受到限制，甚至停滯。這樣就可以使秸稈有機質糖化過程逐漸減弱，直至停止。
穩定保存階段。前述過程產生了大量的乳酸，使pH降低到3.8～4.2，這時乳酸菌的活動逐漸減弱，并開始死亡，pH降低趨勢趨于停止，其他微生物的代謝活動也基本停滯。濕儲秸稈體系微生物的生物化學過程也趨于結束，濕儲存過程基本完成，在沒有氧氣進入和酸度值不變的條件下，秸稈中有機質等成分保持相對的穩定。
秸稈濕儲存的技術核心，一般來說就是控制秸稈呼吸作用和微生物發酵過程。控制呼吸作用，主要發生在儲存的前期。采收果穗后的秸稈，盡可能在短期內切碎壓實、密封，以便盡可能排出秸稈體系內空氣，減少空氣殘余量。否則，秸稈細胞持續呼吸導致溫度升高，有利于其他微生物繁殖。秸稈中水分的含量也是保證乳酸菌正常活動的重要條件，水分過高過低都會影響到秸稈儲存材料的品質。控制微生物的發酵過程產生，主要是在儲存過程中期，嚴格控制物料的pH。采取措施保證乳酸菌的大量繁殖條件，使體系內形成足量的乳酸，抑制霉菌和腐敗菌的生長。為達到最好效果，必要時可以直接向體系內補充乳酸菌，或者加入甲酸、乙酸、丙酸等酸性物質，使得體系的pH迅速降至4.2以下，降低霉菌和腐敗菌等對有機質的腐蝕，提高秸稈有機質的完好率。
上述儲存的生化過程就是濕儲存技術的基本理論，它提示我們，濕儲存應把握三點技術關鍵，一是秸稈收獲后要減少切斷受傷，在最短的時間內（尤其是粉碎的秸稈）進入儲存倉并壓實；二是保證儲存倉的厭氧（兼氧）條件；三是嚴格控制儲存倉的pH在4.2以下。
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